À propos de
Je suis un bioinformaticien spécialisé dans les technologies génomiques, le séquençage des nanopores en temps réel, l'analyse du signal, l'apprentissage automatique et le matériel associé. J'ai une formation en développement de logiciels et plus d'une décennie d'expérience dans l'industrie de la pathologie.
À la tête du développement informatique au sein du groupe des technologies génomiques du Centre de génomique des populations de l'Institut de recherche médicale Garvan, j'applique mes compétences uniques pour développer de nouveaux outils bioinformatiques, ainsi que pour concevoir et soutenir l'infrastructure de séquençage des nanopores.
Mes domaines de recherche incluent :
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Analyse du signal nanopore
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Essais cliniques et développement de méthodes
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Troubles à répétition courte en tandem
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Génomique virale (VIH/SARS-Cov-2)
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Séquençage unicellulaire
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Séquençage direct de l'ARN
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Assemblage du génome
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Détection de méthylation
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Apprentissage automatique/profond
Vivre
Institut Garvan / Analyste des systèmes génomiques
Juin 2017 - PRESENT, Darlinghurst
Cerebro Biosystems / Co-fondateur et CTO
Octobre 2017 - PRESENT, Darlinghurst
Healius (Santé Primaire) / Sénior Développeur de logiciels
Décembre 2017 - PRESENT, St Leonards
Institut Garvan / Assistant de recherche
Déc 2016 - Juin 2017, Darlinghurst
Soins de santé primaires / programmeur analyste
Juin 2015 - Juin 2017, St Leonards
Douglas Hanly Moir Pathologie / Assistant de laboratoire
2011 - 2015, Parc Macquarie
Davies Campbell De Lambert/Healthscope Pathologie/Aide de laboratoire
2009-2011, Ryde
Prix
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2020 - Prix de l'affiche finaliste - London Calling
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2019 - Prix de la conférence sur l'éclairage - ABACBS/GIW
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2018 - Prix Palmer Innovation - Prix Garvan
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2017 - Prix J&J - Med Tech's Got Talent
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2017 - Prix Garvan : pour avoir dépassé les attentes en soutenant la culture bioinformatique chez Garvan
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2017 - Late breaking poster award - Conférence AGTA
Compétences
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Linux/UNIX, BASH
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Python, programmation statistique R, C, AHK, SQL
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conception d'algorithme
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Calcul Haute Performance (SGE)
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Bioinformatique, science des données
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administration système, automatisation, mise en réseau,\
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Systèmes d'information de laboratoire (LIS)