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À propos de

Je suis un bioinformaticien spécialisé dans les technologies génomiques, le séquençage des nanopores en temps réel, l'analyse du signal, l'apprentissage automatique et le matériel associé. J'ai une formation en développement de logiciels et plus d'une décennie d'expérience dans l'industrie de la pathologie.
 

À la tête du développement informatique au sein du groupe des technologies génomiques du Centre de génomique des populations de l'Institut de recherche médicale Garvan, j'applique mes compétences uniques pour développer de nouveaux outils bioinformatiques, ainsi que pour concevoir et soutenir l'infrastructure de séquençage des nanopores.

Mes domaines de recherche incluent :

  • Analyse du signal nanopore

  • Essais cliniques et développement de méthodes

  • Troubles à répétition courte en tandem

  • Génomique virale (VIH/SARS-Cov-2)

  • Séquençage unicellulaire

  • Séquençage direct de l'ARN

  • Assemblage du génome

  • Détection de méthylation

  • Apprentissage automatique/profond

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Vivre

Institut Garvan / Analyste des systèmes génomiques

Juin 2017 - PRESENT,  Darlinghurst

Cerebro Biosystems / Co-fondateur et CTO

Octobre 2017 - PRESENT,  Darlinghurst

Healius (Santé Primaire) / Sénior Développeur de logiciels 

Décembre 2017 - PRESENT,  St Leonards

Institut Garvan / Assistant de recherche

Déc 2016 - Juin 2017,  Darlinghurst

Soins de santé primaires / programmeur analyste

Juin 2015 - Juin 2017,  St Leonards

Douglas Hanly Moir Pathologie / Assistant de laboratoire

2011 - 2015,  Parc Macquarie

Davies Campbell De Lambert/Healthscope Pathologie/Aide de laboratoire

2009-2011,  Ryde

Prix

  • 2020 - Prix de l'affiche finaliste - London Calling

  • 2019 - Prix de la conférence sur l'éclairage - ABACBS/GIW

  • 2018 - Prix Palmer Innovation - Prix Garvan

  • 2017 - Prix J&J - Med Tech's Got Talent

  • 2017 - Prix Garvan : pour avoir dépassé les attentes en soutenant la culture bioinformatique chez Garvan

  • 2017 - Late breaking poster award - Conférence AGTA

Compétences

  • Linux/UNIX, BASH

  • Python, programmation statistique R, C, AHK, SQL

  • conception d'algorithme

  • Calcul Haute Performance (SGE)

  • Bioinformatique, science des données

  • administration système, automatisation, mise en réseau,\

  • Systèmes d'information de laboratoire (LIS)

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